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市场地位认证

Oxford Nanopore开发连接智能手机的纳米孔测序仪

Oxford Nanopore开发连接智能手机的纳米孔测序仪


       牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)透露,正在开发一种连接智能手机使用的纳米孔传感器,用于DNA测序和其他应用中。公司还对其他研发中的新产品进行了介绍。另外,该公司成立了一家分公司,名为Genome Foundry,关注合成生物学的应用。

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开发连接智能手机使用的纳米孔仪器SmidgIon

       公司首席技术官Clive Brown透露,这款新型纳米孔仪器称作SmidgIon,正处于早期研发阶段,预计在2017年末可以投入使用。该产品同样将使用应用于MinIon和PromethIon仪器的核心纳米孔传感技术,但是该仪器将比MinIon更小,每个flow cell中有256个channel,可以连接到智能手机上或者其他低功率仪器上,用于感应DNA、RNA或蛋白质。

       据公司透露,SmidgIon可应用于更加广泛的领域,包括疾病爆发中的病原体监测,分析环境样本或者农业样本,对于野生动植物或木材进行实时物种鉴定。

其他正在开发中的产品

       Brown说,另一个处于早期研发阶段的产品称作Project Zumbador,该产品将生物学样本的核酸提取和文库制备结合到一个设备中,将在第三季度发布。

       公司同时还在研发MinIon和PromethIon上直接进行RNA测序的kits,这项产品计划在接下来的几个月内提供给开发者。公司表示,该产品可利用adapter和马达蛋白控制RNA移位,指导RNA进入纳米孔。Oxford使用这种方法已经对来自人类鼻病毒的RNA进行了测序,并表示直接进行RNA测序可以检测到RNA上的甲基化修饰。

       另外一个产品VolTrax是一款样本制备仪器,将在今年秋天提前供应给目前使用Oxford纳米孔测序平台的客户。公司表示,首批发布的仪器VolTrax将依附在一个小型USB仪器上,然后附着于MioIon或者PromethIon仪器上。

       Oxford Nanopore同样还计划不久后实现MinKonw平台碱基识别软件的本地使用。

第一台PromethIon近期已经出货

       Brown说,第一台PromethIon近期已经出货给客户了,他还展示了该平台的一些内部数据,共使用了48个flow cell,每个flow cell中含有3000个channel。使用R9试剂,每个纳米孔每秒测序250个碱基,准确率和小孔利用率都与MinIon一致。该系统目前的性能是运行48小时产生6.2Tb数据,将来会进一步增加至12.4Tb。根据Brown的报告,公司目前正在调试软件用于控制大型数据集的碱基实时识别,优化芯片表面化学试剂以及生产流程,并开发一种快速的碱基识别程序。

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